Системата за електрофореза се състои от два основни компонента: захранване и камера за електрофореза. Захранването осигурява захранване. „Силата“ в този случай е електричество. Електричеството, което идва от захранването, тече в една посока от единия край на камерата за електрофореза към другия. Катодът и анодът на камерата са това, което привлича противоположно заредени частици.
Вътре в камерата за електрофореза има тава - по-точно тава за отливане. Тавата за отливане се състои от следните части: стъклена плоча, която влиза в дъното на тавата за отливане. Гелът се държи в тавата за отливане. "Гребенът" прилича на името си. Гребенът се поставя в слотове отстрани на тавата за отливане. Поставя се в слотовете ПРЕДИ да се излее горещият, разтопен гел. След втвърдяване на гела гребена се изважда. „Зъбите“ на гребена оставят малки дупчици в гела, които ние наричаме „ямки“. Гнезда се правят, когато горещият, разтопен гел се втвърди около зъбците на гребена. Гребенът се издърпва, след като гелът се охлади, оставяйки кладенчета. Ямките осигуряват място за поставяне на частиците, които искате да тествате. Човек трябва да бъде много внимателен да не наруши гела при зареждане на частиците. Напукването или счупването на гела вероятно ще повлияе на вашите резултати.